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技術平台

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簡介

以實現超大規模生物信息學計算為中心任務,不斷提升其在高效能計算、雲計算服務能力,為海量數據處理提供創新解決方案。

華大基因擁有深圳、香港、北京、武漢、杭州等數個大型生物信息學超級計算中心,總峰值計算能力達到 820.1028 T flops, 總内存容量達到 243.144 TB,總存儲能力達到 104.3152 PB(截至 2018 年 3 月)。其中位于深圳和香港的集群的峰值計算能力分列國内生物信息領域第一和第二位,有能力為海量生物信息學數據的存儲、處理和分析提供穩定而高效的資源保障。下表所示為華大基因在中國各地所部屬的超級計算集群及對應性能。

Site

CPU Cores

Memory(TB)

Storage(PB)

T flops

Shenzhen

38936

168.48

73.0208

537.6112

Hong Kong

8336

12

15.59

93

Wuhan

7088

27.58

9.4408

89.2256

Beijing

684

2.548

0.77

8.2584

TianJin

632

2.42

0.65

14.2

Qingdao

1680

15.144

2.0536

26.88

Chongqing

384

2

0.27

6.76

Taihe

384

2

0.27

6.76

Kunhua

384

2

0.27

6.76

Changyuan

384

2

0.27

6.76

CHOPS

876

3.872

0.77

12.1376

Denmark

920

2.6

0.65

9.6

Austrilia

112

0.5

0.29

2.15

Total

60800

243.144

104.3152

820.1028

華大基因現有大型計算集群運算存儲能力一覽表

随着基因研究技術進步,生物信息數據的存儲計算需求每 12 到 18 個月就會增長 10 倍,遠遠高于摩爾定律提供的參考數值。在生物信息大爆炸的宏觀背景下,華大基因對計算硬件資源的投入也在不斷攀升。2014 年,華大基因第一個超過 1PFLOPS 計算能力的超級計算集群将正式投入使用。屆時,該集群将成為國内乃至國際生物信息學界新的性能标杆。

華大基因已具備全球領先的超大規模生物信息計算與分析能力,除此之外還與國内最快的超級計算機“天河一号”所在的國家超算天津中心合作,成立了天河——華大生物信息計算聯合實驗室,依托國家超級計算中心,在濱海新區打造國際領先的基因數據計算及研發北方基地。此次合作雙方将從高性能計算應用研發領域入手,對現有生物信息計算軟件分析流程優化,發揮“天河一号”的計算能力,針對海量數據的儲存和處理,開發出高質量的生物信息學計算分析工具,快速求解各類需要大量計算的生物信息難題,從海量生物信息數據中挖掘出各種生命現象的内在規律。

“天河一号”(TH-1A)超級計算機 天河•天騰(TH-1)系統

深圳華大科技(總部)

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